A partir del contexto de pandemia en marzo del 2020 desde la secretaría de estado en coordinación con el área de salud se  establecieron los correspondientes protocolos en los dispositivos Caina niños y adolescentes en las localidades donde están circunscriptos.

Se mantuvieron sucesivas reuniones para garantizar las medidas de bioseguridad dentro y fuera de los dispositivos, se garantizaron y garantizan en todo momento los EPP (mascarillas, guantes, camisolines, alcohol, alfombras sanitizantes, termómetro digital, barbijos) para todo el personal como así también se realizaron reuniones informativas a través de plataforma zoom con relación a los protocolos a seguir en las instituciones.

Desde las áreas de salud de las distintas localidades donde subyacen los cainas a partir de la detección de un posible caso de covid positivo al interior de la institución se activa el protocolo impartido.

En la localidad de sierra grande el monitoreo y seguimiento dentro y fuera de la institución lo realiza la Dra. Claudia Iriarte 

En Bariloche, los Dres. Marcos Clauser y la Dra. Gabriela Velazquez. En Viedma, los Dres Fedorco y Colinichesco. En El Bolsón, la Dra Claudia Duelle. En Roca, el Dr. Mauricio.

Los referentes mencionados del área de salud son los encargados de impartir las pautas a seguir como así también el seguimiento de cada caso en particular. Para lo cual están en permanente contacto con los directores de los cainas.

Los trabajadores de estos dispositivos han sido vacunados en su totalidad por considerarse personal esencial de SENAF.